利用空港数71 / 85 （2013-04-30現在、定期便が就航している空港に限定）
| 名称 | 空港分類 | 空港コード | 滑走路（方位・延長x幅員） | 最終利用日 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3レター | 4レター | 到着 | 出発 | ||||
| ○ | 稚内空港 | 拠点（国管理） | WKJ | RJCW | 08/26 2200x45 | 2005-09-10 | |
| ○ | 利尻空港 | 地方管理 | RIS | RJER | 07/25 1800x45 | 2005-09-05 | |
| ○ | 旭川空港 | 拠点（特定地方管理） | AKJ | RJEC | 16/34 2500x60 | 2009-06-06 | |
| ○ | 紋別空港（オホーツク紋別空港） | 地方管理 | MBE | RJEB | 14/32 2000x45 | 2006-07-01 | |
| ○ | 女満別空港 | 地方管理 | MMB | RJCM | 18/36 2500x45 | 2003-05-31 | 2003-06-01 |
| ○ | 中標津空港（根室中標津空港） | 地方管理 | SHB | RJCN | 08/26 2000x45 | 1996-08-21 | 2008-09-11 |
| ○ | 釧路空港（たんちょう釧路空港） | 地方管理 | KUH | RJCK | 17/35 2500x45 | 2006-03-12 | |
| ○ | 帯広空港（とかち帯広空港） | 拠点（特定地方管理） | OBO | RJCB | 17/35 2500x45 | 2010-09-04 | |
| ○ | 札幌飛行場（丘珠空港） | 共用 | OKD | RJCO | 14/32 1500x45 | 2008-09-11 | 1996-08-21 |
| ○ | 新千歳空港 | 拠点（国管理） | CTS | RJCC | 01L/19R 3000x60 01R/19L 3000x60 |
2009-11-07 | 2012-06-24 |
| ○ | 函館空港 | 拠点（国管理） | HKD | RJCH | 12/30 3000x45 | 2008-09-06 | 2008-09-07 |
| ○ | 奥尻空港 | 地方管理 | OIR | RJEO | 13/31 1500x45 | 2008-09-07 | |
| ○ | 青森空港 | 地方管理 | AOJ | RJSA | 06/24 3000x60 | 2009-05-17 | 2009-05-17 |
| ○ | 三沢飛行場 | 共用 | MSJ | RJSM | 10/28 3050x45 | 2007-06-10 | |
| ○ | 大館能代空港（あきた北空港） | 地方管理 | ONJ | RJSR | 11/29 2000x45 | 2001-11-18 | |
| ○ | 秋田空港 | 拠点（特定地方管理） | AXT | RJSK | 10/28 2500x60 | 2006-06-03 | 2006-06-03 |
| ○ | 花巻空港（いわて花巻空港） | 地方管理 | HNA | RJSI | 02/20 2500x45 | 2007-06-09 | |
| ○ | 庄内空港 | 地方管理 | SYO | RJSY | 09/27 2000x60 | 2006-07-08 | 2006-07-08 |
| ○ | 山形空港 | 地方管理 | GAJ | RJSC | 01/19 2000x45 | 2007-03-04 | 2007-03-04 |
| ○ | 仙台空港 | 拠点（国管理） | SDJ | RJSS | 12/30 1200x45 09/27 3000x45 |
2006-03-11 | 2006-03-12 |
| ○ | 福島空港 | 地方管理 | FKS | RJSF | 01/19 2500x60 | 2006-04-30 | |
| ○ | 百里飛行場（茨城空港） | 共用 | IBR | RJAH | 03R/21L 2700x45 03L/21R 2700x45 |
2012-02-26 | |
| ○ | 成田国際空港（成田空港） | 拠点（会社管理） | NRT | RJAA | 16R/34L 4000x60 16L/34R 2500x60 |
2009-09-08 | 2009-09-05 |
| ○ | 東京国際空港（羽田空港） | 拠点（国管理） | HND | RJTT | 16R/34L 3000x60 04/22 2500x60 16L/34R 3000x60 05/23 2500x60 |
2013-04-14 | 2013-04-30 |
| 調布飛行場 | その他 | RJTF | 17/35 800x30 | ||||
| ○ | 大島空港 | 地方管理 | OIM | RJTO | 03/21 1800x45 | 2006-05-27 | 2006-05-27 |
| 新島空港 | 地方管理 | RJAN | 11/29 800x25 | ||||
| 神津島空港 | 地方管理 | RJAZ | 11/29 800x25 | ||||
| 三宅島空港 | 地方管理 | MYE | RJTQ | 02/20 1200x30 | |||
| ○ | 八丈島空港 | 地方管理 | HAC | RJTH | 08/26 2000x45 | 2007-10-20 | 2007-10-20 |
| ○ | 新潟空港 | 拠点（国管理） | KIJ | RJSN | 10/28 2500x45 04/22 1314x45 |
2011-10-30 | 2011-10-29 |
| ○ | 佐渡空港 | 地方管理 | SDS | RJSD | 10/28 890x25 | 2011-10-29 | 2011-10-30 |
| ○ | 富山空港（富山きときと空港） | 地方管理 | TOY | RJNT | 02/20 2000x45 | 2006-09-03 | 2006-06-10 |
| ○ | 能登空港 | 地方管理 | NTQ | RJNW | 07/25 2000x45 | 2006-04-22 | 2006-04-22 |
| ○ | 小松飛行場 | 共用 | KMQ | RJNK | 06/24 2700x45 | 2007-03-04 | 2009-09-11 |
| ○ | 松本空港（信州まつもと空港） | 地方管理 | MMJ | RJAF | 18/36 2000x45 | 2008-07-20 | |
| 静岡空港（富士山静岡空港） | 地方管理 | FSZ | RJNS | 12/30 2500x60 | |||
| ○ | 中部国際空港（セントレア） | 拠点（会社管理） | NGO | RJGG | 18/36 3500x60 | 2006-04-30 | 2007-06-09 |
| ○ | 名古屋飛行場（県営名古屋空港） | その他 | NKM | RJNN | 16/34 2740x45 | 2004-09-24 | |
| ○ | 関西国際空港（関西空港） | 拠点（会社管理） | KIX | RJBB | 06R/24L 3500x60 06L/24R 4000x60 |
2007-02-10 | 2009-11-14 |
| ○ | 大阪国際空港（伊丹空港） | 拠点（会社管理） | ITM | RJOO | 14L/32R 1828x45 14R/32L 3000x60 |
2009-11-14 | 2009-09-26 |
| ○ | 神戸空港（マリンエア） | 地方管理 | UKB | RJBE | 09/27 2500x60 | 2006-03-11 | 2012-02-26 |
| ○ | 南紀白浜空港 | 地方管理 | SHM | RJBD | 15/33 2000x45 | 2009-04-18 | 2013-04-14 |
| ○ | 但馬飛行場（コウノトリ但馬空港） | その他 | TJH | RJBT | 01/19 1200x30 | 2009-08-23 | 2009-08-23 |
| ○ | 岡山空港 | 地方管理 | OKJ | RJOB | 07/25 3000x45 | 2009-03-28 | |
| ○ | 鳥取空港 | 地方管理 | TTJ | RJOR | 10/28 2000x45 | 2010-05-23 | |
| ○ | 美保飛行場（米子鬼太郎空港） | 共用 | YGJ | RJOH | 07/25 2000x45 | 2010-05-22 | |
| ○ | 出雲空港（出雲縁結び空港） | 地方管理 | IZO | RJOC | 07/25 2000x45 | 2007-02-17 | 2007-02-17 |
| ○ | 隠岐空港 | 地方管理 | OKI | RJNO | 08/26 2000x45 | 2009-08-29 | 2009-08-30 |
| ○ | 石見空港（萩・石見空港） | 地方管理 | IWJ | RJOW | 11/29 2000x45 | 2006-06-17 | 2006-06-17 |
| ○ | 広島空港 | 拠点（国管理） | HIJ | RJOA | 10/28 3000x60 | 2009-11-03 | 2009-11-03 |
| ○ | 岩国飛行場（岩国錦帯橋空港） | 共用 | IWK | RJOI | 02/20 2440x60 | 2013-04-30 | |
| ○ | 山口宇部空港 | 拠点（特定地方管理） | UBJ | RJDC | 07/25 2500x45 | 1996-03-09 | |
| ○ | 高松空港 | 拠点（国管理） | TAK | RJOT | 08/26 2500x60 | 2005-03-14 | |
| ○ | 徳島飛行場（徳島阿波おどり空港） | 共用 | TKS | RJOS | 11/29 2500x45 | 2006-04-29 | 2006-04-30 |
| ○ | 松山空港 | 拠点（国管理） | MYJ | RJOM | 14/32 2500x45 | 2009-07-04 | 2009-07-04 |
| ○ | 高知空港（高知龍馬空港） | 拠点（国管理） | KCZ | RJOK | 14/32 2500x45 | 2006-05-21 | 2006-05-21 |
| ○ | 北九州空港 | 拠点（国管理） | KKJ | RJFR | 18/36 2500x60 | 2009-10-17 | 2009-10-17 |
| ○ | 福岡空港 | 拠点（国管理） | FUK | RJFF | 16/34 2800x60 | 2011-09-18 | 2013-01-04 |
| ○ | 対馬空港（対馬やまねこ空港） | 地方管理 | TSJ | RJDT | 14/32 1900x45 | 2011-09-17 | 2011-09-18 |
| 壱岐空港 | 地方管理 | IKI | RJDB | 02/20 1200x30 | |||
| ○ | 福江空港 | 地方管理 | FUJ | RJFE | 03/21 2000x45 | 2003-09-22 | 2003-09-22 |
| ○ | 長崎空港 | 拠点（国管理） | NGS | RJFU | 14/32 3000x60 | 2004-09-24 | 2004-09-26 |
| ○ | 佐賀空港（有明佐賀空港） | 地方管理 | HSG | RJFS | 11/29 2000x45 | 2006-07-08 | 2006-07-08 |
| ○ | 熊本空港（阿蘇くまもと空港） | 拠点（国管理） | KMJ | RJFT | 07/25 3000x45 | 2008-10-29 | 2008-10-29 |
| 天草飛行場 | その他 | AXJ | RJDA | 13/31 1000x30 | |||
| ○ | 大分空港 | 拠点（国管理） | OIT | RJFO | 01/19 3000x45 | 2002-09-07 | |
| ○ | 宮崎空港 | 拠点（国管理） | KMI | RJFM | 09/27 2500x45 | 2009-09-21 | 2012-03-25 |
| ○ | 鹿児島空港 | 拠点（国管理） | KOJ | RJFK | 16/34 3000x45 | 2009-05-31 | 2009-05-31 |
| ○ | 種子島空港（コスモポート種子島） | 地方管理 | TNE | RJFG | 13/31 2000x45 | 2009-05-30 | 2009-05-30 |
| 屋久島空港 | 地方管理 | KUM | RJFC | 14/32 1500x45 | |||
| ○ | 奄美空港 | 地方管理 | ASJ | RJKA | 03/21 2000x45 | 2009-04-30 | 2009-04-30 |
| ○ | 喜界空港 | 地方管理 | KKX | RJKI | 07/25 1200x30 | 2009-04-30 | 2009-04-30 |
| ○ | 徳之島空港 | 地方管理 | TKN | RJKN | 01/19 2000x45 | 2009-05-31 | 2009-05-31 |
| 沖永良部空港 | 地方管理 | OKE | RJKB | 04/22 1350x45 | |||
| 与論空港 | 地方管理 | RNJ | RORY | 14/32 1200x30 | |||
| ○ | 那覇空港 | 拠点（国管理） | OKA | ROAH | 18/36 3000x45 | 2012-08-06 | 2012-08-04 |
| 粟国空港 | 地方管理 | AGJ | RORA | 01/19 800x25 | |||
| ○ | 久米島空港 | 地方管理 | UEO | ROKJ | 03/21 2000x45 | 2009-06-13 | 2009-06-13 |
| 北大東空港 | 地方管理 | KTD | RORK | 03/21 1500x45 | |||
| 南大東空港 | 地方管理 | MMD | ROMD | 02/20 1500x45 | |||
| ○ | 宮古空港 | 地方管理 | MMY | ROMY | 04/22 2000x45 | 2009-05-09 | 2009-05-09 |
| 多良間空港 | 地方管理 | TRA | RORT | 18/36 1500x45 | |||
| ○ | 石垣空港（南ぬ島石垣空港） | 地方管理 | ISG | ROIG | 04/22 2000x45 | 2012-08-04 | 2012-08-06 |
| ○ | 与那国空港 | 地方管理 | OGN | ROYN | 08/26 2000x45 | 2003-03-23 | 2003-03-25 |